En noviembre de 2022, Néstor Vargas Solano fue propuesto por la presidenta Claudia Sheinbaum como representante de su gobierno ante el nuevo Órgano de Administración Judicial, a pesar de haber sido acusado de abuso sexual agravado y acoso sexual mientras se desempeñaba como consejero Jurídico y de Servicios Legales. La denuncia en su contra, presentada por una excolaboradora, se registró el 8 de noviembre de 2022 en la Fiscalía de Investigación de Delitos Sexuales de la FGJCDMX.
La acusación se hizo pública a finales de enero de 2023, y en una conferencia del 1 de febrero de ese año, Sheinbaum fue interrogada sobre el asunto. Resaltó que había solicitado a la Fiscalía que resolviera rápidamente la denuncia y que la Secretaría de las Mujeres interviniera para hablar con la víctima. Sheinbaum mantuvo que, mientras se realizara una investigación justa, no había discutido el tema con Vargas Solano, pero sí con las autoridades correspondientes para garantizar que se tomaran las decisiones adecuadas.